負責預算之編審、經費科目之審核等。預算係由各組室提供資料，參照上年度核定預算已執行情形，考量自然增減驅勢，並以開源節流力求量入為出之原則，核實編列，及依照行政院農業委員會發布『臺灣省農田水利會年度事業預算編審要點』編製，提交會務委員會審議通過報行政院農業委員會核定後，編列分配預算交由各組室執行管制；於年度結束時，依據各種帳簿辦理決算之編擬及分析各科目之執行情形。

會計收支業務

1. 會計業務已全部電腦化，並直接產生相關報表，對減少人工及增加工作效率，成果相當卓著。
   
2. 本室在審查收支憑證一向非常謹慎，如有缺少證明文件或缺蓋印章，主計室並刻有主計室退件印章隨時退時補正。
   
3. 本會在收支方面一向遵照事務管理規則規定日期辦理。
   

統計業務

1. 每年均彙集各單位業務統計報表資料編製「雲林農田水利會統計要覽」一冊，以提供上級及各單位參考用。
   
2. 督促本會各單位業務有關水利類公務統計報表，各類報表均能準時精確編報，並呈送上級機關。
   
3. 已編製完成「雲林農田水利會簡介」中文版，供外界對本會業務之營運能獲得深入暸解。
   
4. 編製「農田水利文物館簡介」中、英文版，使參觀人士易於暸解展示內容及意義，以達到宣傳目的。